REKAP

Durada

01/10/2025 - 30/09/2027

Coordinador

Anna Roca

Finançadors

The Gates Foundation

L'Àfrica suporta la major càrrega mundial de mortalitat perinatal; parlem de gairebé la meitat de totes les morts fetals i neonatals precoces (definides com les que es produeixen en les primeres 72 hores després del naixement). L’evidència de estudis de cohorts realitzats a Gàmbia i Burkina Faso, que inclouen més de 12.000 dones embarassades i els seus fills, indica que més del 80% de les morts neonatals es produeixen durant aquest període neonatal precoç. Les taxes de mortalitat perinatal van oscil·lar entre 17 i 30 per cada 1.000 parts en diferents contextos de l’Àfrica subsahariana.

ISGlobal i els altres socis han obtingut recentment un projecte (GBS-A; Gates Foundation, INV-091973) per avaluar el paper de l’estreptococ del grup B (Streptococcus del grup B, GBS) en les morts fetals dins de la cohort PRECISE. Aquesta iniciativa aprofita mostres biològiques existents (sang de cordó i teixit placentari) i dades clíniques recollides en l’estudi de cohort maternoinfantil PRECISE (www.precisenetwork.org). Sobre aquesta base, el projecte REKAP amplia l’abast per investigar altres patògens de gran rellevància.

Evidències emergents suggereixen que una proporció significativa de les morts fetals pot estar associada a Enterobacteriaceae, especialment Escherichia coli i Klebsiella pneumoniae. Al mateix temps, augmenta la inversió en el desenvolupament de vacunes dirigides a aquests patògens. Comprendre la seva contribució a la mortalitat perinatal, així com identificar correlats immunitaris de protecció, és clau per accelerar el desenvolupament de vacunes, orientar estratègies d’immunització materna i identificar dones amb més risc.

Objectiu i objectius

L’objectiu general del projecte REKAP és determinar el paper de E. coli i K. pneumoniae en la mortalitat perinatal, incloses les morts fetals i les morts dins de les primeres 72 hores després del naixement.

Objectius principals

• Estimar la càrrega i el risc atribuïble poblacional (PAR) de E. coli i K. pneumoniae en la mortalitat perinatal.
• Identificar correlats immunitaris de protecció (per exemple, anticossos específics) contra aquests patògens mitjançant mostres de sang de cordó i vaginals.
• Transferir tecnologia d’anàlisi immunològica basada en Luminex a un laboratori a Sud-àfrica.

Objectius secundaris

• Identificar factors de risc demogràfics, epidemiològics i serològics associats a la mortalitat perinatal.
• Avaluar factors de risc per a la colonització rectovaginal per E. coli i K. pneumoniae.

Disseny de l’estudi

El projecte utilitzarà un disseny retrospectiu de casos i controls basat en dades i mostres recollides en la cohort PRECISE a Gàmbia, Kenya i Moçambic.

Casos: morts fetals intrapart (≥22 setmanes de gestació, definició ICD-11) i morts neonatals precoces (dins de les primeres 72 hores).

Controls: nounats amb puntuacions d’Apgar normals (≥7 al minut i als 5 minuts) que es mantenen sans durant el període neonatal.

S’inclouran aproximadament 205 casos i 410 controls (proporció 1:2). Els càlculs de potència estadística tindran en compte la prevalença de patògens i el risc atribuïble poblacional.

S’utilitzarà un disseny anidat de casos i controls per estudiar els correlats immunitaris de protecció, incloent casos positius a patògens i dos grups de control: (i) morts perinatals negatives per als patògens i (ii) nounats sans.

Mostres i mètodes de laboratori

L’estudi inclourà 615 parelles mare–nounat. Les anàlisis es realitzaran utilitzant sang de cordó, sang materna i exsudats vaginals emmagatzemats al biobanc PRECISE.

Detecció de patògens

• qPCR: detecció i quantificació altament sensible d’ADN bacterià en mostres enriquides per cultiu.
• Microbiologia: identificació basada en cultiu i proves de sensibilitat als antibiòtics segons estàndards internacionals.

El control de qualitat es garantirà mitjançant validació entre centres, reanalitzant el 5% de les mostres per confirmar la consistència.

Anàlisi genòmica

La seqüenciació del genoma complet es durà a terme a la unitat MRC de Gàmbia per caracteritzar la resistència antimicrobiana, els perfils de virulència i la diversitat genètica dels aïllats.

Perfil immunològic

ISGlobal liderarà les anàlisis immunològiques utilitzant assajos multiplex basats en microesferes (xMAP Luminex) per quantificar anticossos contra antígens seleccionats de E. coli i K. pneumoniae. També es podran utilitzar plataformes complementàries (com Olink) per identificar signatures de biomarcadors relacionades amb la resposta immunitària i la inflamació.

Anàlisi estadística

S’utilitzaran models de regressió logística per estimar odds ratios (OR) i intervals de confiança del 95% en les associacions entre infecció i mortalitat perinatal. El risc atribuïble poblacional (PAR) es calcularà en conseqüència. Anàlisis addicionals exploraran factors de risc i correlats immunitaris de protecció.

Transferència tecnològica

ISGlobal donarà suport al reforç de capacitats mitjançant la transferència de tecnologia Luminex a un laboratori a Sud-àfrica. Això inclou:

• Un programa de formació presencial de dos mesos als laboratoris d’ISGlobal.
• Formació en assegurament de la qualitat, processament i anàlisi de dades.
• Suport remot durant 6–8 mesos.
• Una visita tècnica de seguiment a la institució sòcia.

Aquest enfocament té com a objectiu reforçar la capacitat investigadora local i garantir la sostenibilitat d’anàlisis immunològiques avançades en entorns de renda baixa i mitjana.

Finançament total

$556,556

Finançat per la Gates Foundation.