expoStat

Duration

2016-2018

Coordinator

Juan R. González (ISGlobal)

Funded by

Ministerio de Economía, Industria y Competitividad (Gobierno de España)

El proyecto pretende desarrollar una infraestructura para llevar a cabo un análisis integrativo utilizando todos los datos obtenidos de un estudio prototipo que monitoriza múltiple información ‘ómica’ y exposición ambiental para distintos puntos de tiempo (Proyecto europeo HELIX). La innovación en esta metodología requiere el desarrollo de métodos estadísticos para analizar diferentes tecnologías ‘ómicas’, su integración, detección de perfiles que permitan la estratificación de individuos y la confirmación de significación biológica mediante el preproceso de datos que permita la obtención de características con sentido biológico.

Estos métodos estadísticos son implementados mediante metodologías basadas en computación de alto rendimiento (HPC, por sus siglas en inglés) que permite al personal investigador abordar el problema computacional que aparece cuando se analizan tablas de datos gigantes. La evaluación del comportamiento de los métodos son evaluados mediante estudios de simulación así como mediante el análisis de datos reales incluyendo validación experimental utilizando muestras biológicas que están accesibles en nuestro centro. Además, las herramientas desarrolladas, los algoritmos y datos son puestos a disposición de la comunidad científica mediante código abierto y librerías en el proyecto Bioconductor.

Estas herrramientas permitirá a otros equipos analizar sus propios datos así como otros datos existentes mediante la combinación de distintas fuentes de información como datos clínicos mutaciones, expresión génica o metilación. La información sobre cómo cambios en estados fisiológicos están correlacionados con las componentes moleculares monitorizadas, tendrá aplicaciones en el diagnóstico de enfermedades complejas mediante la implementación médica de una medicina más precisa y personalizada.

Financiación

29.040 euros