Bioestadística y Gestión de Datos

La Unidad de Bioestadística y Gestión de Datos (UBIOES-DM) de ISGlobal inició sus actividades en 1994 con el objetivo de proporcionar apoyo en datos a los grupos de investigación del Hospital Clínic de Barcelona y a sus colaboradores.

Este equipo de profesionales ofrece asesoramiento, servicios y formación con tal de dar respuesta a las necesidades de gestión de datos y análisis estadístico de proyectos de investigación biomédica, clínica o ambiental. Este apoyo cubre todo el ciclo de vida de los datos, desde su creación hasta su preservación y compartición, con el objetivo de transformar la información en conocimiento.

Para cubrir todas estas necesidades, la Unidad de Bioestadística y Gestión de Datos está formada por gestores de datos (data managers) y analistas de datos que proporcionan los servicios especializados detallados más abajo.

Servicios

1. Gestión de datos

• Diseño y organización de datos
  • Asesoramiento y apoyo en la implementación de procedimientos de recogida y gestión de datos en proyectos de investigación, seleccionando las herramientas y sistemas más adecuados en cada caso, así como en el diseño del estudio
  • Amplio conocimiento de diferentes herramientas y sistemas de captura y gestión de datos (sistemas EDC: Electronic Data Capture), como REDCap, LibreClinica, OpenClinica, KoboToolBox y ODK
  • Diseño de bases de datos, aplicaciones y/o adaptaciones necesarias para cubrir los requisitos específicos del proyecto
  • Importación de datos desde otras bases de datos o migración desde otros sistemas
  • Establecimiento de herramientas y protocolos de recogida de datos (basados en GCDMP: Good Clinical Data Management Practices) y seguridad de los sistemas EDC
  • Soporte, documentación y formación para distintos perfiles de usuario de datos
  • Creación, revisión y mejora de planes de gestión de datos (DMP)

• Procesamiento de datos
  • Elaboración de informes periódicos sobre el progreso de la entrada de datos
  • Control y monitorización de la calidad de los datos
  • Cuadros de mando e informes resumen de datos
  • Definición de procedimientos de monitorización de datos y apoyo en su implementación
  • Exportaciones de datos personalizadas y cierre seguro de proyectos y datos

2. Curación y publicación de datos

• Estandarización y homogeneización de conjuntos de datos
• Adaptación de los datos a los principios FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable)
• Publicación de datos en el repositorio CORA u otros repositorios basados en Dataverse

3. Análisis de datos

• Servicio de asesoramiento
  • Cálculo del tamaño muestral
  • Diseño estadístico del proyecto de investigación
  • Redacción de la metodología estadística para solicitudes de financiación
  • Redacción y revisión de la metodología estadística para publicaciones científicas
  • Asesoramiento puntual en metodología estadística
  • Elaboración del plan de análisis estadístico (SAP)
  • Aleatorización de participantes en ensayos clínicos

• Análisis estadístico
  • Análisis descriptivo de datos
  • Modelización estadística
  • Técnicas de aprendizaje automático
  • Visualización de datos

• Monitorización de datos y seguridad (DSMB)
  • Generación de informes de evaluación estadística para ensayos clínicos
  • Gestión de la recogida de datos de eventos adversos
  • Asesoramiento estadístico independiente para el grupo de seguridad (DSMB)
  • Análisis estadísticos ciegos o abiertos por parte del grupo de seguridad (DSMB)

4. Formación

• Cursos cortos (menos de 4 horas):
  • Estadística básica con Stata
  • Regresión lineal con Stata
  • Regresión logística con Stata
  • Gestión de datos con Excel (Excel no es una herramienta de gestión de datos)
  • Conceptos básicos de gestión de datos en investigación y ciclo de vida de los datos

• Curso de estadística básica (parte del máster en Salud Global UB / ISGlobal)

Equipamiento

• Aplicaciones de captura y gestión de datos: REDCap, LibreClinica, OpenClinica, KoboToolBox, ODK
• Aplicaciones de visualización e informes: R Shiny, R Markdown, Google Data Studio
• Software estadístico: Stata, Stata MP, R, PASS
• Desarrollo de aplicaciones: PHP, Python, Java, R Shiny
• Bases de datos: MySQL, MS Access, Google BigQuery, MongoDB
• Procedimientos ETL (Extract, Transform, Load) y diseño de pipelines de extracción de datos

Este servicio científico (core facility) se integra en la plataforma CERCAGINYS.

Proyectos seleccionados

• CaDMIA y CaDMIA+
  Validación de la Autopsia Mínimamente Invasiva (MIA, por sus siglas en inglés) como herramienta para investigar las causas de muerte en países en desarrollo
  Entidad financiadora: Bill & Melinda Gates Foundation (2013-2015 y 2016-2018)
  Estado: Finalizado
• The Mamah Project
  Entidad financiadora: EU-European and Developing Countries Clinical Trials Partnership (EDCTP)
  Estado: En curso
• BOHEMIA: Ivermectina para la malaria
  Entidad financiadora: Unitaid (OMS)
  Estado: En curso
• TIPTOP: Transforming Intermittent Preventive Treatment for Optimal Pregnancy
  Entidad financiadora: Unitaid (OMS)
  Estado: En curso
• ICARIA: Improving Care through Azithromycin Research for Infants in Africa
  Entidad financiadora: Bill & Melinda Gates Foundation; Fundación ”la Caixa”
  Estado: En ejecución
• MULTIPLY: MULTIple doses of IPTi Proposal: a Lifesaving high Yield intervention
  Entidad financiadora: EU-European and Developing Countries Clinical Trials Partnership (EDCTP)
  Estado: En ejecución
• ChagasLAMP: Validación en campo de Trypanosoma cruzi-LAMP: una prueba molecular en el punto de atención para el control de la enfermedad de Chagas congénita
  Entidad financiadora: Global Health Innovative Fund (GHIT)
  Estado: En ejecución
• TESEO: Nuevos regímenes de quimioterapia y biomarcadores para la enfermedad de Chagas
  Entidad financiadora: U.S. National Institutes of Health (NIH)
  Estado: En ejecución
• MIBio: Identificación de la prematuridad y la preeclampsia como causas de mortalidad
  Entidad financiadora: Bill & Melinda Gates Foundation
  Estado: Finalizado
• MA-CoV: Salud materna y COVID-19
  Entidad financiadora: EU-European and Developing Countries Clinical Trials Partnership (EDCTP)
  Estado: Finalizado
• SEROCOV: Seroprevalencia de anticuerpos frente al SARS-CoV-2 entre profesionales sanitarios en un gran hospital de referencia español
  Entidad financiadora: Generalitat de Catalunya
  Estado: En ejecución
• MESA-Track: Base de datos dinámica que recopila proyectos de investigación y carteras institucionales en eliminación y erradicación de la malaria
  Entidad financiadora: Bill & Melinda Gates Foundation
  Estado: En ejecución

Publicaciones seleccionadas

• Khomenko S, Cirach M, Barrera-Gómez J, Pereira-Barboza E, Iungman T, Mueller N, Foraster M, Tonne C, Thondoo M, Jephcote C, Gulliver J, Woodcock J, Nieuwenhuijsen M. Impact of road traffic noise on annoyance and preventable mortality in European cities: a health impact assessment. Environ Int. 2022;162:107160. https://doi.org/10.1016/j.envint.2022.107160
• Koch S, Khomenko S, Cirach M, Ubalde-Lopez M, Baclet S, Daher C, Hidalgo L, Lõhmus M, Rizzuto D, Rumpler R, Susilo Y, Venkataraman S, Wegener S, Wellenius GA, Woodcock J, Nieuwenhuijsen M. Impacts of changes in environmental exposures and health behaviours due to the COVID-19 pandemic on cardiovascular and mental health: a comparison of Barcelona, Vienna, and Stockholm. Environ Pollut. 2022;119124. https://doi.org/10.1016/j.envpol.2022.119124
• Alemany S, Crous-Bou M, Vilor-Tejedor N, Milà-Alomà M, Suárez-Calvet M, Salvadó G, Cirach M, Arenaza-Urquijo EM, Sánchez-Benavides G, Grau-Rivera O, Minguillon C, Fauria K, Kollmorgen G, Domingo Gispert J, Gascon M, Nieuwenhuijsen M, Zetterberg H, Blennow K, Sunyer J, Molinuevo JL, ALFA Study. Associations between air pollution and biomarkers of Alzheimer’s disease in cognitively unimpaired individuals. Environ Int. 2021;157:106864. https://doi.org/10.1016/j.envint.2021.106864
• de Bont J, Hughes R, Tilling K, Díaz Y, de Castro M, Cirach M, Fossati S, Nieuwenhuijsen M, Duarte-Salles T, Vrijheid M. Early-life exposure to air pollution, green spaces and the built environment, and body mass index growth trajectories during the first 5 years of life: a large longitudinal study. Environ Pollut. 2020;266:115266. https://doi.org/10.1016/j.envpol.2020.115266
• Perelló J, Cigarini A, Vicens J, Bonhoure I, Rojas-Rueda D, Nieuwenhuijsen MJ, Cirach M, Daher C, Targa J, Ripoll A. Large-scale citizen science provides high-resolution nitrogen dioxide values and health impact while enhancing community knowledge and collective action. Sci Total Environ. 2021;789:147750. https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.147750
• Fernandez-Barres S, Robinson O, Fossati S, Márquez S, Basagaña X, de Bont J, de Castro M, Donaire-González D, Maitre L, Nieuwenhuijsen M, Romaguera D, Urquiza J, Chatzi L, Iakovides M, Vafeiadi M, Grazuleviciene R, Dedele A, Andrusaityte S, Aasvang GM, Evandt J, Hjertager Krog N, Lepeule J, Heude B, Wright J, McEachan RRC, Sassi F, Vineis P, Vrijheid M. Urban environment and health behaviours in children from six European countries. Environ Int. 2022;165:107319. https://doi.org/10.1016/j.envint.2022.107319
• de Bont J, Márquez S, Fernandez-Barres S, Warembourg C, Koch S, Persavento C, Fochs S, Pey N, de Castro M, Fossati S, Nieuwenhuijsen M, Basagaña X, Casas M, Duarte-Salles T, Vrijheid M. Urban environment and obesity and weight-related behaviours in primary school children. Environ Int. 2021;155:106700. https://doi.org/10.1016/j.envint.2021.106700
• Grazuleviciene R, Hernandez-Ferrer C, Heude B, McEachan R, Mon-Williams M, Nieuwenhuijsen M, Robinson O, Sakhi AK, Sebastián-Gallés N, Slama R, Sunyer J, Tamayo-Uria I, Thomsen C, Urquiza J, Vafeiadi M, Wright J, Basagaña X, Vrijheid M. Early-life multiple exposures and child cognitive function: a multicentric birth cohort study in six European countries. Environ Pollut. 2021;284:117404. https://doi.org/10.1016/j.envpol.2021.117404
• Maitre L, Julvez J, Lopez-Vicente M, Warembourg C, Tamayo-Uria I, Philippat C, Gutzkow KB, Guxens M, Andrusaityte S, Basagaña X, Casas M, de Castro M, Chatzi L, Evandt J, González JR, Grazuleviciene R, Småstuen Haug L, Heude B, Hernandez-Ferrer C, Kampouri M, Manson D, Márquez S, McEachan R, Nieuwenhuijsen M, Robinson O, Slama R, Thomsen C, Urquiza J, Vafeiadi M, Wright J, Vrijheid M. Early-life environmental exposure determinants of child behaviour in Europe: a longitudinal, population-based study. Environ Int. 2021;153:106523. https://doi.org/10.1016/j.envint.2021.106523
• Granum B, Oftedal B, Agier L, Siroux V, Bird P, Casas M, Warembourg C, Wright J, Chatzi L, de Castro M, Donaire D, Grazuleviciene R, Småstuen Haug L, Maitre L, Robinson O, Tamayo-Uria I, Urquiza J, Nieuwenhuijsen M, Slama R, Thomsen C, Vrijheid M. Multiple environmental exposures in early life and allergy-related outcomes in childhood. Environ Int. 2020;144:106038. https://doi.org/10.1016/j.envint.2020.106038
• Vrijheid M, Fossati S, Maitre L, Márquez S, Roumeliotaki T, Agier L, Andrusaityte S, Cadiou S, Casas M, de Castro M, Dedele A, Donaire-González D, Grazuleviciene R, Haug LS, McEachan R, Meltzer HM, Papadopoulou E, Robinson O, Sakhi AK, Siroux V, Sunyer J, Schwarze PE, Tamayo-Uria I, Urquiza J, Vafeiadi M, Valentin A, Warembourg C, Wright J, Nieuwenhuijsen MJ, Thomsen C, Basagaña X, Slama R, Chatzi L. Early-life environmental exposures and childhood obesity: an exposome-wide approach. Environ Health Perspect. 2020;128(6):67009. https://doi.org/10.1289/EHP5975
• Agier L, Basagaña X, Hernandez-Ferrer C, Maitre L, Tamayo-Uria I, Urquiza J, Andrusaityte S, Casas M, de Castro M, Cequier E, Chatzi L, Donaire-González D, Giorgis-Allemand L, González JR, Grazuleviciene R, Gutzkow KB, Haug LS, Sakhi AK, McEachan RRC, Meltzer HM, Nieuwenhuijsen M, Robinson O, Roumeliotaki T, Sunyer J, Thomsen C, Vafeiadi M, Valentin A, West J, Wright J, Siroux V, Vrijheid M, Slama R. Association between the pregnancy exposome and fetal growth. Int J Epidemiol. 2020;49(2):572–586. https://doi.org/10.1093/ije/dyaa017