Investigación, Resistencias a antibióticos

Describen una nueva especie bacteriana con potencial patógeno

La nueva especie de 'Acinetobacter' se aisló a partir de muestras de pacientes de diferentes países y porta genes de resistencia a antibióticos

17.01.2017
Foto: Marí-Almirall M et al, 2016

Un equipo liderado por Ignasi Roca, investigador de ISGlobal y Jordi Vila, director de la Iniciativa de Resistencia Antimicrobiana, describe una nueva especie de Acinetobacter aislada a partir de muestras de pacientes de diferentes países. En una serie de tres artículos publicados recientemente, los investigadores muestran por métodos moleculares que dichos aislados pertenecen a una nueva especie del complejo Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii (ACB), y la nombraron Acinetobacter dijkshoorniae en honor a Lenie Dijkshoorn, una microbióloga holandesa que ha dedicado su vida al estudio del género Acinetobacter

En primer lugar, los autores caracterizaron un grupo de 12 cepas obtenidas principalmente de pacientes a lo largo de 15 años y que diferían genéticamente de otras especies del complejo ACB. Usando técnicas moleculares avanzadas, los autores demostraron que dichas cepas constituyen un grupo distinto de las otras especies del complejo ACB, aunque estrechamente relacionado con Acinetobacter pittii. La nueva especie, bautizada con el nombre de Acinetobacter dijkshoorniae, tiene como « cepa tipo » a la cepa JVAP01T, aislada de un paciente en Turquía en el 2009. 

Paralelamente, los autores secuenciaron el genoma entero de JVAP01T y encontraron que porta varios genes que confieren resistencia a antibióticos, incluyendo el gen blaNDM-1, que confiere resistencia a la mayoría de antibióticos beta-lactámicos y está localizado en un plásmido (un elemento circular de ADN transferible entre bacterias), y el gen aphA6, que confiere resistencia a algunos aminoglucósidos. Mediante un programa que predice la patogenicidad bacteriana, los autores muestran que la nueva especie tiene una alta probabilidad de ser un patógeno humano y comparte secuencias con otras familias patogénicas, incluyendo cepas de A. baumannii.

Finalmente, los autores buscaron determinar si A. dijkshoorniae y Acinetobacter seifertii (otra especie recientemente descrita) se pueden distinguir de otras especies de Acinetobacter mediante un método basado en la espectrometría de masas (MALDI-TOF/MS) que se está utilizando con éxito en el laboratorio para diferenciar las otras especies del complejo ACB. La correcta identificación es importante, ya que las diferentes especies de Acinetobacter difieren en términos de susceptibilidad antibiótica y desenlace clínico. Utilizando un programa informático para procesar los distintos perfiles proteicos, los autores lograron identificar señales específicas para cada una de las especies.  “La incorporación de estas nuevas ‘firmas moleculares’ a la base de datos permitirá la identificación rápida y automatizada de todas las especies del complejo ACB”, explica Jordi Vila. Esto a su vez, “permitirá evaluar la relevancia clínica y epidemiológica de las diferentes especies de la familia, y facilitará el tratamiento y manejo de las infecciones por Acinetobacter.

Los brotes de infecciones por Acinetobacter ocurren normalmente en unidades de cuidados intensivos y en ámbitos sanitarios que alojan a pacientes muy enfermos. Acinetobacter suele ser resistente a muchos de los antibióticos más comunes.   

Referencias:

Cosgaya C, Marí-Almirall M, Van Assche A, Fernández-Orth D, Mosqueda N, Telli M, Huys G, Higgins PG, Seifert H, Lievens B, Roca I, Vila J. Acinetobacter dijkshoorniae sp. nov., a member of the Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter baumannii complex mainly recovered from clinical samples in different countries. Int J Syst Evol Microbiol. 2016 Oct;66(10):4105-4111.

Marí-Almirall M, Cosgaya C, Higgins PG, Van Assche A, Telli M, Huys G, Lievens B, Seifert H, Dijkshoorn L, Roca I, Vila J. MALDI-TOF/MS identification of species from the Acinetobacter baumannii (Ab) group revisited: inclusion of the novel A. seifertii and A. dijkshoorniae species. Clin Microbiol Infect. 2016 Dec 3.

Fernández-Orth D, Cosgaya C, Telli M, Mosqueda N, Marí-Almirall M, Roca I, Vila J. Draft Genome Sequence of JVAP01T, the Type Strain of the Novel Species Acinetobacter dijkshoorniae. Genome Announc. 2017 Jan 12;5(2).