Recerca - El nostre equip

Juan R. Gonzalez és Associate Research Professor d'ISGlobal, on dirigeix el Grup de Recerca en Bioinformàtica en Epidemiologia Genètica (BRGE).

És coautor de més de 150 articles científics i té una àmplia experiència en grans projectes de recerca internacionals (ATHLETE, HELIX, MEDIRAD y OPERRA). Com a professor adjunt al Departament de Matemàtiques de la Universitat Autònoma de Barcelona, les seves activitats educatives se centren en proporcionar conferències de postgrau sobre mètodes estadístics avançats i bioinformàtica.

Després d'obtenir el seu Ph.D. en Bioestadística, supervisat pel Prof. Edsel Penya de la Universitat de Carolina del Sud (EE.UU.), va passar dos anys com estudiant de postdoctorat al Centre de Regulació Genòmica (CRG). El seu treball se centra en el desenvolupament de mètodes estadístics i computacionals per a l'anàlisi i la comprensió de diferents dades òmiques motivat per una àmplia gamma de preguntes de rellevància biològica i clínica. Aquests inclouen genòmica (CNV, inversions, mosaïcismes), transcriptòmica (RNA-seq i splicing alternatiu) i proteòmica entre d'altres. L'anàlisi de l'exposoma, la seva caracterització i com integrar-lo a diferents capes òmiques és també una altra línia activa de recerca del seu grup.

És autor del llibre "Omic association analysis with R and Bioconductor" que inclou mètodes actualitzats per explotar dades òmiques.

Línies de recerca

  • Mètodes estadístics per explotar dades genòmiques
  • Mètodes robustos i escalabes per al big data en medicina personalitzada
  • Rol de les inversions genòmiques en les malalties complexes
  • Nous mètodes estadístics i eines per analitzar les dades del exposoma
  • Rol de l'elevada desregulació del cromosoma Y en malalties complexes

Publicacions principals

  • Ruiz-Arenas C, Caceres A, Lopez-Sanchez M, Tolosana I, Perez-Jurado L, Gonzalez JR. scoreInvHap: Inversion genotyping for genome-wide association studies. Plos Genetics. 2019;15(7):e1008203.
  • Hernandez-Ferrer C, Wellenius GA, Tamayo I, Basagana X, Sunyer J, Vrijheid M, Gonzalez JR. Comprehensive study of the exposome and omic data using rexposome Bioconductor packages. Bioinformatics. 2019;pii: btz526. doi: 10.1093/bioinformatics/btz526.
  • Hernandez-Ferrer C, Gonzalez JR. CTDquerier: a bioconductor R package for Comparative Toxicogenomics Database data extraction, visualization and enrichment of environmental and toxicological studies. Bioinformatics. 2018;15;34(18):3235-3237.
  • Caceres A, Gonzalez JR. Following the footprints of polymorphic inversions on SNP data: from detection to association tests. Nucleic Acids Res. 2015;43:e53.
  • Gonzalez JR, Caceres A, Esko T, Cusco I, Puig M, Esnaola M, Reina J, SirouxV, Bouzigon E, Nadif R, Reinmaa E, Milani L, Bustamante M, Jarvis D, Anto JM, Sunyer J, Demenais F, Kogevinas M, Metspalu A, Caceres M, Perez-Jurado LA. A common 16p11.2 inversion underlies the joint susceptibility to asthma and obesity. Am J Hum Genet. 2014;94(3):361-72.